O Estranho caso do cachorro morto conta a historia do narrador-personagem Christopher John Francis Boone, um menino de 15 anos que apresenta autismo.
A historia se desenvolve na investigação da morte do cachorro Wellington, que fora encontrado pelo garoto com um forcado em seu pescoço.
Primeiramente, é levado à delegacia por desacato ao policial ao ser questionado sobre seu envolvimento no crime. É proibido de se envolver na situação por seu pai e pelos policiais.
Secretamente, sai em busca de pistas para solucionar o caso e com a ajuda da professora Siobhan, começa a escrever o livro sobre suas aventuras e sentimentos.
Vai às casas de seus vizinhos, mas não consegue provas.
Vive dias bons e ruins com base na cor de carros; vermelhos para aqueles e amarelos para estes.
Após ser expulso pela Sra. Shears, dona de Wellington, conhece a senhora Alexander, que tenta se aproximar do garoto e o mesmo recua.
Em certo ponto da historia, quando vai à loja de sua rua, encontra Alexander e descobre que sua mãe, que de acordo com seu pai morrera de uma complicação no coração, traíra seu pai com o marido da dona de Wellington. Nesse exato momento, acredita que o Sr. Shears pode ter matado o cachorro.
Christopher é excelente em cálculo, e por isso, prestará o exame de proficiência em matemática, para atingir o grau A e cursar a faculdade dentro de pouco tempo.
Seu pai descobre, através do livro, que o filho ainda investiga o assassinato. Após uma discussão, retira o livro do