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El presente se realizara un análisis del ecosistema de la provincia de Atalaya, el cual viene hacer la unidad espacial en la que esta ubicada dicha provincia manteniendo una estrecha relación inherente con el medio que lo rodea. Donde encontraremos que cada especie animal, vegetal e incluso humana tienen un determinado lugar de vida al cual están adaptados.
La palabra Rupa - Rupa procede del runasimi y significa "ardiente". Según Pulgar Vidal, se encuentra al otro lado de los andes, en la parte oriental, ubicándose en los 400 a 1000 msnm en el pie de monte oriental, siendo su temperatura media anual de 22ª a 25ª C , con precipitación pasando los 3000mm.
Su relieve es accidentado, cuenta con cadenas montañosas y altas terrazas cubiertas de vegetación. Los ríos más importantes son Manseriche y Retama (río Marañón), Aguirre (Huallaga), Mainique (Urubamba) y Boquerón del Padre Abad (Yuracyacu).
Flora: la vegetación no es tan tupida como en la selva baja, en ella se encuentra gran variedad de especies tales como barbasco o cube, árbol de pan bombonaje, tamushi, caucho, palmeras, yarina son algunas de as especies que habitan.
Fauna: es variada en ella encontramos aves tales como el paucar, paujil, guachano, ayaymamacu, reptiles como chuchupe, naca naca, así como otras especies como la sachavaca o tapir, sajino, huangana entre otras variedades a encontrar.
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