Genoma. Complemento genético entero y haploide de un organismo. Es decir toda la secuencia de ADN, codificante o no codificante y su posición en los cromosomas.
Genómica. Disciplina que se ocupa de la caracterización de los genomas. Se encuentra dividida en Genómica Estructural y la Genómica Funcional.
Objetivo de la Genómica Estructural es conocer el/los genoma/s de una especie en particular/diferentes especies.
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Genoma y Genómica
Aplicaciones delestudio de los genomas
Predecir genes, secuencias promotoras y reguladoras de la transcripción.
Comparar genomas de diferentes individuos de la misma especie para detectar variaciones o polimorfismos a nivel poblacional. Estas variaciones pueden ser sustituciones, deleciones/inserciones, o rearreglos cromosómicos (cambio de posición en el genoma).
Aplicaciones delestudio de los genomas
Comparar genomas de diferentes especies. Esto permite hacer inferencias acerca de los procesos evolutivos de remodelación de genomas.
Otras.
Genomas eucarióticos y procarióticos
Genomas animales y vegetales
Sizes of eukaryotic genomes
(Gp:) Species
(Gp:) Genome size (Mb)
Fungi
Saccharomyces cerevisiae
12.1
Aspergillus nidulans
25.4
Protozoa
Tetrahymena pyriformis
190
Invertebrates
Caenorhabditis elegans
97
Drosophila melanogaster
180
Bombyx mori (silkworm)
490
Strongylocentrotus purpuratus (sea urchin)
845
Locusta migratoria (locust)
5000
Vertebrates
Takifugu rubripes (pufferfish)
400
Homo sapiens
3200
Mus musculus (mouse)
3300
Plants
Arabidopsis thaliana (vetch)
125
Oryza sativa (rice)
430
Zea mays (maize)
2500
Pisum sativum (pea)
4800
Triticum aestivum (wheat)
16000
Fritillaria assyriaca (fritillary)
120000
Paradoja del valor C
Secuencias repetitivas
Distintos tipos de secuencias repetitivas se encuentran en muchos organismos y ocupan gran parte de los genomas:
Satélites
Pseudogenes
Transposones y retrotransposones
Pueden estar esparcidas por el genoma o en tandem y varían mucho en tamaño.
¿Cómo se estudian los genomas?
Mapeo genético
Mapeo físico
Secuenciación exhaustiva
El mapeo genético
El mapeo genético está basado en la utilización de técnicas genéticas para construir mapas que muestran la posición de marcadores genéticos o de marcadores moleculares. Las técnicas genéticas incluyen experimentos de recombinación y estudio de pedigrees en humanos.
El mapeo físico
El mapeo físico utiliza técnicas de Biología Molecular para examinar directamente las moléculas de ADN para la construcción de mapas que muestran la posición de fragmentos de ADN (en general de secuencia desconocida) en el genoma.
Secuenciación automática
Fragmentos de hasta 700 pb
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