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Ensamblamiento de fragmentos de ADN

Enviado por Pablo Turmero



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Genoma. Complemento genético entero y haploide de un organismo. Es decir toda la secuencia de ADN, codificante o no codificante y su posición en los cromosomas. Genómica. Disciplina que se ocupa de la caracterización de los genomas. Se encuentra dividida en Genómica Estructural y la Genómica Funcional. Objetivo de la Genómica Estructural es conocer el/los genoma/s de una especie en particular/diferentes especies. . Genoma y Genómica

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Aplicaciones del estudio de los genomas Predecir genes, secuencias promotoras y reguladoras de la transcripción. Comparar genomas de diferentes individuos de la misma especie para detectar variaciones o polimorfismos a nivel poblacional. Estas variaciones pueden ser sustituciones, deleciones/inserciones, o rearreglos cromosómicos (cambio de posición en el genoma).

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Aplicaciones del estudio de los genomas Comparar genomas de diferentes especies. Esto permite hacer inferencias acerca de los procesos evolutivos de remodelación de genomas. Otras.

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Genomas eucarióticos y procarióticos

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Genomas animales y vegetales

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Sizes of eukaryotic genomes (Gp:) Species (Gp:) Genome size (Mb) Fungi Saccharomyces cerevisiae 12.1 Aspergillus nidulans 25.4 Protozoa Tetrahymena pyriformis 190 Invertebrates Caenorhabditis elegans 97 Drosophila melanogaster 180 Bombyx mori (silkworm) 490 Strongylocentrotus purpuratus (sea urchin) 845 Locusta migratoria (locust) 5000 Vertebrates Takifugu rubripes (pufferfish) 400 Homo sapiens 3200 Mus musculus (mouse) 3300 Plants Arabidopsis thaliana (vetch) 125 Oryza sativa (rice) 430 Zea mays (maize) 2500 Pisum sativum (pea) 4800 Triticum aestivum (wheat) 16000 Fritillaria assyriaca (fritillary) 120000

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Paradoja del valor C

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Secuencias repetitivas Distintos tipos de secuencias repetitivas se encuentran en muchos organismos y ocupan gran parte de los genomas: Satélites Pseudogenes Transposones y retrotransposones Pueden estar esparcidas por el genoma o en tandem y varían mucho en tamaño.

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¿Cómo se estudian los genomas? Mapeo genético Mapeo físico Secuenciación exhaustiva

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El mapeo genético El mapeo genético está basado en la utilización de técnicas genéticas para construir mapas que muestran la posición de marcadores genéticos o de marcadores moleculares. Las técnicas genéticas incluyen experimentos de recombinación y estudio de pedigrees en humanos.

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El mapeo físico El mapeo físico utiliza técnicas de Biología Molecular para examinar directamente las moléculas de ADN para la construcción de mapas que muestran la posición de fragmentos de ADN (en general de secuencia desconocida) en el genoma.

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Secuenciación automática Fragmentos de hasta 700 pb

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