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Introducción a los algoritmos genéticos en biología




Enviado por Pablo Turmero



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    Son algoritmos de búsqueda de soluciones basados en la mecánica de la selección natural y la genética de poblaciones
    ¿Qué son?

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    Tenemos un problema a resolver.
    Idea base

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    Generamos una "población" de posibles soluciones a ese problema.
    Idea base

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    Asignamos a cada solución un valor de eficacia ("fitness").
    Idea base

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    Las soluciones pueden recombinar y mutar (evolucionan).
    Idea base

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    Dejamos actuar a la evolución via la selección natural para que encuentre la mejor solución (resuelva el problema).
    Idea base

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    Idea base
    Valores iniciales
    Solución

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    ¡En un algoritmo genético el entorno es el problema a resolver y los organismos las posibles soluciones del mismo!
    Resumiendo

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    Para poder aplicar un AG a un problema debemos determinar:
    Una codificación genética para el problema.
    Una función de ajuste (eficacia o fitness) que asigne un valor a cada individuo de acuerdo con su comportamiento en el medio.
    Resumiendo

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    Resumiendo
    Los AG's tradicionales manejan cadenas de símbolos de longitud fija llamadas cromosomas.
    Asociado a cada una de las posiciones de la cadena hay un gen. Los símbolos que constituyen un gen se llaman alelos (0/1 en el caso binario de 2 alelos).

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    1.- Trabajamos con poblaciones de posibles soluciones a nuestro problema.
    Para que haya "evolución" tiene que haber variación sobre la que pueda actuar la "selección natural".
    ¿Cómo se realizan?

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    2.- Cada posible solución depende de un conjunto de parámetros que tomarán unos valores u otros.
    ¿Cómo se realizan?
    (Gp:) 0
    (Gp:) 0
    (Gp:) 0
    (Gp:) 0
    (Gp:) 1
    (Gp:) 0
    (Gp:) 0
    (Gp:) 0

    = individuo (cromosoma) de una población
    parámetros

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